Registro completo de metadatos
| Campo DC | Valor | Lengua/Idioma |
|---|---|---|
| dc.provenance | Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la UBA | - |
| dc.contributor | Hopp, Horacio Esteban | - |
| dc.contributor | Tosto, Daniela S. | - |
| dc.creator | Tosto, Daniela S. | - |
| dc.date.accessioned | 2018-05-04T21:57:59Z | - |
| dc.date.accessioned | 2018-05-28T16:37:45Z | - |
| dc.date.available | 2018-05-04T21:57:59Z | - |
| dc.date.available | 2018-05-28T16:37:45Z | - |
| dc.date.issued | 2002 | - |
| dc.identifier.uri | http://10.0.0.11:8080/jspui/handle/bnmm/73923 | - |
| dc.description | Oxalis tuberosa, comúnmente conocida como oca, es una de las 8 especies andinas con raíces y tubérculos comestibles que juegan un rol importante en los sistemas agrícolas de las tierras altas de la región andina. Estos cultivos son de gran importancia económica y nutricional para la subsistencia de los agricultores de los Andes y un potencial alimento para el resto de la humanidad. La oca pertenece al género Oxalis, el cual está distribuido mundialmente e incluye alrededor de 800 especies. La mayor diversidad se encuentra en América del Sur y en Sud Africa; siendo las especies de América del Sur las que presentan el mayor rango de variación en cuanto a características morfológicas, ecológicas y citológicas. Los estudios citogenéticos revelaron una gran diversidad en el número básico de cromosomas variando desde X=5 a X=12, siendo X=7 el número más frecuente. Los niveles de poliplodía en el género también son variables (2n a 8n). De Azkue y Martínez (l990) encontraron que un grupo de once especies, que eran semejantes morfológicamente, compartían un número básico de cromosomas X=8. A este grupo pertenecen O. herrerae, O. medicaginea, O. mollissima, O. oblongiformis, O. peduncularis, O. subintegra, O. tabaconanensis. O.aff. víllosula (todas estas diploides), O. lotoides (2n=32), O. spiralis (2n=48) y la oca (O. tuberosa), un octoploide. A este grupo lo denominaron “la alianza de O. tuberosa”. Sin embargo este agrupamiento no coincide con la clasificación basada en criterios de taxonomía tradicional. El estudio de las especies silvestres relacionadas a los cultivos puede dar idea del proceso de domesticación y la evolución de los mismos, por otro lado pueden tener aplicaciones prácticas dado que las especies silvestres relacionadas a los cultivos son reservorios genéticos para el mejoramiento de los mismos. La caracterización de las distintas variedades y accesiones de O. tuberosa que existen es fundamental para saber con la diversidad que se cuenta y para el manejo de los bancos de germoplasma. Dentro de este marco los objetivos generales del presente estudio fueron por un lado poner a prueba, con herramientas de la taxonomía molecular, la hipótesis cromosómica que relaciona a O. tuberosa y con otras especies del género por compartir el mismo número básico de cromosomas X=8. Por otro lado evaluar distintas herramientas moleculares para cuantificar y comparar la diversidad genética de representantes del género y, más particularmente, de la especie cultivada, con el objeto de contribuir criterios objetivos para la conservación de estos recursos genéticos y su mejoramiento con fines agrícolas. Para lo cual se realizó el análisis de los genes ribosomales y se analizaron patrones de AFLP. El análisis de la región del espaciador interno de los genes ribosomales (ITS) corroboró la hipótesis cromosómica que relaciona a O. tuberosa y las especies que comparten el mismo número básico de cromosomas X=8. El análisis de AFLP también apoyó la hipótesis cromosómica ya que tanto en el análisis de agrupamientos como en el análisis mediante coordenadas principales las especies de la alianza se diferenciaron respecto de O. articulata generándose en el primer caso un dendrograma que sostenía este agrupamiento con un coeficiente de correlación cofenética de 0,99. El segundo análisis permitió identificar a las combinaciones de primers E41-M39 y E45- M43 como las que más aportaron a dicho agrupamiento. Los resultados no son del todo consistentes con los obtenidos a través de la taxonomía tradicional mediante descripciones puramente morfológicas, tanto en el caso de las clasificaciones que dividen a las distintas especies de la alianza en cuatro secciones (Knuth, 1939, 1936) como el caso en que las dividen en dos (Lourteig, 2000). De todos modos, la clasificación basada en datos moleculares de las especies de la alianza es más congruente con la propuesta taxonómica de Lourteig (2000) y puede ayudar a afinarla. El análisis de los genes ribosomales a nivel de la región codificante (la más conservada), muestra mayor similitud entre O. tuberosa y O. oblongiformis. Esta observación, sí sería congruente con la taxonomía tradicional, ya que ambas especies fueron las únicas de las especies estudiadas, agrupadas en la misma sección por Knuth (en Ortgiesae) y por Lourteig (en Lotoideae). Lo incongruente sería que, en su monografía, Lourteig (2000) sinonimizó a O. oblongiformis con O. tabaconasensis. El análisis del ADNr, pero a nivel de la región del IGS (la más variable) dio una idea de la compleja estructura de estas secuencias hipervariables en la alianza. Dado que es una región altamente variable no esclareció demasiado la relación de las especies diploides y poliploide cultivada, pero aportó información interesante de la relación entre las especies diploídes. Las tres especies diploides que comparten el mismo patrón de bandas fueron ubicadas por Knuth en tres secciones diferentes, mientras que por Lourteig en dos. Así mismo, esta parte del ADNr demostraría la inconsistencia de sinonimizar O. oblongiformis y O. tabaconasensis (Lourteig 2000). El análisis de los resultados obtenidos por los AFLP aparte de apoyar la hipótesis cromosómica de la alianza, permitieron visualizar el potencial de la técnica de AFLP para la caracterización de las distintas accesiones del cultivo y su utilización para el manejo de los bancos de germoplasma. Ya que se permitieron diferenciar accesiones que figuran con el mismo número, como así también identificar posibles duplicados, accesiones que figuran con distinto número, pero tienen perfiles de bandas idénticos. Siendo las combinaciones de primers E45-M43, E69-M69 y E41-M39 las que más incidieron para explicar la variación observada. | - |
| dc.description | Oxalis tuberosa, commonly known as oca, is one of the 8 Andean species with edible underground roots and tubers that play a major role in the Andean highland farming systems. These crops are of great economic and nutritional importance to subsistence Andean farmers and a potential source of food for the whole mankind. Oca belongs to the genus Oxalis, that is worldwide distributed and represented by at least 800 species most of them in the southern hemisphere, mainly in America and South Africa, being South American species the most diverse in morphologigal, ecological and cytogenetic characteristics. Cytogenetic studies revealed a great deal of variability in the basic number of chromosomes (from X=5 to X=12), X=7 is the more frequent, as well as variation in the ploidy degree, that ranges from 2n to 8n (Marks, 1956; Cronquist, 1981; Naranjo et al., 1982; de Azkue, 1986; de Azkue & Martínez, 1983, 1984, 1989, 1990). Among them, a group of 12 species that share the same basic number of chromosomes (x=8) was defined by de Azkue & Martínez (1990). The group of species is named “the O. tuberosa alliance”. To this group belongs O. herrerae, O. medicaginea, O. mollissima, O. oblongiformis, O. peduncularis, O. subintegra, O. tabaconanensis, O. aff. villosula (all diploids species), O. Iotoides (2n=32), O. spiralis (2n=48) and the oca (O. tuberosa), an octoploid. However, this grouping is not consistent with the classification based on traditional taxonomy criteria. The study of the wild species related with the crop could help to clarify the processes of domestication and evolution of the oca. Furthermore, this study has practical applications since related wild species are natural genetic reservoirs for breeding. Characterization of different cultivars and accessions is very important in order to acknowledge the existing diversity and germplasm management. In this context, the general objectives of the present study were: first, to corroborate the chromosome hypothesis that relates O. tuberosa with the other species that share the same basic chromosome number, X=8. Second, to evaluate different molecular tools to quantitate and compare the genetic diversity of the different species of the genus, and particularly, within the crop species, so contributing objective criteria for genetic resources conservation and breeding. For these purposes, rDNA sequence analyses by RFLP complemented by nucleotide sequencing as well as AFLP were carried out. Comparative ribosomal intergenic transcribed sequences (ITS) analysis corroborated the hypothesis of relativeness of the species that share the same basic number of chromosome X=8. No differences were detected among the diploid species or within the O. tuberosa species. When diploid and polyploid species were compared, four differences were observed, two transitions in the ITS1 and two transversions in the ITS2. In contrast, when the species belonging to the alliance were compared to with an external reference species (O. articulata), several differences were found. The AFLP results also showed to be in good agreement with the cytogenetic hypothesis. Both cluster analysis and principal coordinates analysis discriminated the alliance species from O. articulata. In the first case, a dendrogram from UPGMA cluster analysis that show this grouping was obtained, and its very high cophenetic coefficient value (r = 0.99) indicates excellent fitness to the genetic similarity matrix. The co-ordinates analysis allowed to identify the primer combination E4l-M39 y E45-M43, as the most significant for this grouping. The results obtained from these analyses are not so consistent with those from the traditional taxonomy. Neither in the case of Knuth's classification (1930, 1936) by which the species of the alliance belong to four different sections, nor in the case of Lourteig (2000), which separates them in two different sections. In any case, the last classification is more congruent with the molecular data, which may help to refine it. O. tuberosa and O. oblongiformis showed identical restriction endonuclease patterns for the transcribed rDNA regions, which is consistent with conventional taxonomy, since both species were classified in the same section by Knuth (in Ortigiesae) and Lourteig (in Lotoideae). However, in the last case, the defined synonymy between O. oblongiformis and O. tabaconanensis is inconsistent with the molecular data shown here. Restriction endonuclease and sequence analyses of the IGS revealed a subrepeat organization which sequence and organization showed such degree of variation that did not allow relating polyploid to diploid species. However, the molecular organization of IGS rDNA contributed some important information on the relationship among diploids species. The three species that share the same pattern in this variable region, were classified by Knuth in three different sections, while they were classified in two by Lourteig. The IGS sequence also showed the inconsistency of the sinonimy between O. oblongiformis and O. tabaconanensis by Lourteig (2000). The AFLP analysis not only supported the chromosome hypothesis but also showed that AFLP is a powerful tool to characterize the different crop accessions and its usefulness for germplasm characterization and management (for example, for the identification of duplicate accessions), being the E45-M43, E69-M69 and E41-M39 primer combinations the most significant to explain the observed variability. | - |
| dc.description | Fil:Tosto, Daniela S.. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. | - |
| dc.format | application/pdf | - |
| dc.language | spa | - |
| dc.publisher | Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires | - |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | - |
| dc.rights | http://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar | - |
| dc.source.uri | http://digital.bl.fcen.uba.ar/gsdl-282/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=tesis&d=Tesis_3534_Tosto | - |
| dc.title | Estudio de las relaciones genómicas y de similitud genética relativa entre especies del germoplasma del cultivo andino "oca" (Oxalis tuberosa) mediante análisis de AFLP y secuencias de ADN ribosomal | - |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/doctoralThesis | - |
| dc.type | info:ar-repo/semantics/tesis doctoral | - |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion | - |
| Aparece en las colecciones: | FCEN - Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. UBA | |
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