Registro completo de metadatos
| Campo DC | Valor | Lengua/Idioma |
|---|---|---|
| dc.provenance | RIUNNE - Universidad Nacional del Nordeste | - |
| dc.contributor | Canteros, Blanca Isabel | - |
| dc.contributor | Gieco, Jorge Omar | - |
| dc.creator | Lezcano, Cecilia Carolina | - |
| dc.date | 2018 | - |
| dc.date.accessioned | 2020-02-17T15:33:45Z | - |
| dc.date.available | 2020-02-17T15:33:45Z | - |
| dc.date.issued | 2018 | - |
| dc.identifier | Lezcano, C. C. (2018). Caracterización genética de pomelo 'Paraná' mediante marcadores moleculares (Tesis de maestría). Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias, Corrientes, Argentina. | - |
| dc.identifier | http://repositorio.unne.edu.ar/handle/123456789/1545 | - |
| dc.identifier.uri | http://rodna.bn.gov.ar/jspui/handle/bnmm/576399 | - |
| dc.description | Fil: Lezcano, Cecilia Carolina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Corrientes. Estación Experimental Agropecuaria en Bella Vista; Argentina. | - |
| dc.description | Fil: Canteros, Blanca Isabel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Corrientes. Estación Experimental Agropecuaria en Bella Vista; Argentina. | - |
| dc.description | Fil: Gieco, Jorge Omar. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina. | - |
| dc.description | El género Citrus al igual que los géneros Fortunella (kumquat) y Poncirus (naranjo trifolio) pertenecen a la familia Rutacea (subfamilia Aurantoidea, tribu Citreae) subtribu Citrinae, y son los tres géneros de importancia comercial en la familia. La gran diversidad de especies y variedades en el género Citrus, se debe principalmente a la ocurrencia de mutaciones y la frecuente aparición de semillas poliembriónicas. El pomelo ‘Paraná’ (Citrus sp.) como la mayoría de las especies cítricas, surgió en el Sudoeste asiático, en contraste con los demás pomelos (C. paradisi) cuyo centro de origen fue en las islas Barbados, en el Caribe. Tal como los citrus diploides, pomelo ‘Paraná’ cuenta con número cromosómico 2n= 18. Además de presentar características industriales mejoradas, como la calidad de frutos y buen comportamiento a campo, el pomelo ‘Paraná’ ha demostrado alta resistencia cuantitativa a la cancrosis de los cítricos, enfermedad bacteriana causada por Xanthomonas citri subsp citri. Esta enfermedad es endémica en la zona del NEA, afecta a todos los cítricos, pero en particular todas las variedades de pomelo son muy susceptibles. En la actualidad, las investigaciones en cuanto a sanidad, principalmente están dirigidas a la obtención de nuevas variedades cítricas para contrarrestar las pérdidas producidas por una enfermedad nueva en la zona, cuyo agente causal es la bacteria Candidatus Liberibacter y provoca el “greening” o HLB (huanglongbing). Enfermedad muy devastadora en los cítricos que ha causado y sigue afectando ampliamente la producción de todas las variedades cítricas. En plantas cultivadas y en especial en Citrus, la caracterización de material genético ha sido dificultosa debido a que la alta fertilidad entre especies, la reproducción apomíctica y poliembrionía son habituales, así como la escasez de marcadores de ADN polimórficos. A su vez, la identificación de variedades y en particular, cultivares derivadas por mutaciones espontáneas e inducidas, sigue siendo una tarea difícil. En tal sentido, se planteó la siguiente hipótesis: el estudio de la diversidad genética relativa de pomelo ‘Paraná’ y su correspondiente caracterización genética mediante marcadores moleculares específicos del genoma cítrico permite genotipificar el material de interés facilitando la evaluación del grado de parentesco relativo del pomelo ‘Paraná’ con las demás especies cítricas. Consecuentemente, los objetivos propuestos fueron: caracterizar molecularmente pomelo ‘Paraná’ y otras especies cítricas mediante marcadores de ADN. Caracterizar mediante el uso de marcadores SSR y RAPD el material de pomelo ‘Paraná’. Estimar posibles relaciones de parentesco de pomelo ‘Paraná’ con otras especies y variedades cítricas conocidas. Con el fin de analizar la variabilidad y estructura genética se emplearon marcadores nucleares RAPD y SSR. El análisis de la variabilidad genética mediante RPAD reveló que el porcentaje de loci polimórficos y la heterocigosis esperada promedio fueron elevados en pomelo ‘Paraná’. Sin embargo, no se detectaron bandas exclusivas. Asimismo, el Índice de diversidad para el mismo también resultó elevado. El mayor número de alelos diferentes se observó en naranja ‘Valencia’ (C. sinensis), pomelo ‘Duncan’ (C. paradisi) y pomelo ‘Paraná’ (Citrus sp.). Sin embargo, el porcentaje de loci polimórficos (PLP) varió entre las muestras, los mayores valores de PLP en general se observaron en cultivares de pomelo, entre ellos pomelo ‘Duncan’ y pomelo ‘Paraná’ obtenidos con SSR. A su vez, la heterocigosis esperada y el índice de diversidad resultaron mayores en naranja ‘Valencia’. Sin embargo, la variabilidad dentro de cada variedad fue en general escasa. El análisis de la estructuración genética de germoplasma cítrico, indicó que el mayor grado de división se da entre variedades. Asimismo, en el análisis de la varianza molecular (AMOVA) las variedades resultaron genéticamente diferentes entre sí y los resultados fueron estadísticamente significativos. La mayor distancia genética se observó entre pomelo ‘Paraná’ y naranja ‘Salustiana’ (C. sinensis) (1,666) y entre ‘Paraná’ y ‘Poorman’ (Citrus sp.) (1,020). A su vez, los índices Fst y PhiPT indicaron menor distancia genética entre pomelo ‘Paraná’ y naranja ‘Valencia’ (Fst 0,233 y PhiPT 0,394) y entre pomelo ‘Paraná’ y C. maxima (pummelo) (Fst 0,311 y PhiPT 0,490). Es decir que están mucho más relacionados genéticamente éstos que cualquier otra. El análisis de coordenadas principales agrupó principalmente pomelo ‘Paraná’ y naranja ‘Valencia’, y C. maxima muy cercana a ellos. En el análisis de UPGMA se diferenció el pomelo híbrido ‘Poorman’ del resto de las variedades. En principio, los caracteres morfológicos distintivos que permitieron diferenciar agronómicamente las variedades de pomelo, C. paradisi (‘Marsh’, ‘Foster’, ‘Duncan’, ‘Red Blush’, ‘Red Shambar’ y ‘Star Ruby’), no coincidieron con la similitud genética entre éstos. Se logró diferenciar genéticamente pomelo ‘Paraná’ y se la consideró como una variante distinta, separada de otros cultivares de pomelo. Se pudo establecer que el pomelo ‘Paraná’ es un híbrido natural independiente, originado posiblemente del cruzamiento de una variante de naranja dulce (Citrus x sinensis) y pummelo (C. maxima). El analisis exhaustivo de pomelo ’Paraná’, considerando los portainjertos (‘Rangpur’, tangelo ‘Orlando’, ‘Citrumelo’ y ‘Duncan’) demostró que estos no influyen en el agrupamiento debido a que no hay diferencias en cuanto a las distancias genéticas y las similitudes son muy elevadas. Los resultados indicaron que la selección visual en combinación con el análisis de SSR para la identificación y caracterización de híbridos mejorará la precisión de la selección, ahorrará tiempo y reducirá los costos involucrados en los programas de mejoramiento genético cítrico. Al mismo tiempo, los SSR son técnicas eficaces en la identificación de genotipos que muchas veces se comercializan con el mismo nombre y que pueden acarrear problemas en la comercialización. A su vez, con este trabajo se logró avanzar en la caracterización genética del pomelo ‘Paraná’. Esto favorece y al mismo tiempo beneficia la comercialización, dada la demanda del mismo, ya que brinda información complementaria para la inscripción en el INASE. De esta manera se potencia el estudio del germoplasma cítrico y los trabajos futuros para la identificación de variedades comerciales. | - |
| dc.description | The genus Citrus as well as the genera Fortunella (kumquat) and Poncirus (orange trifolio) belong to the family Rutacea (subfamily Aurantoidea, tribe Citreae) subtribe Citrinae, and are the three genera of commercial importance in the family. The great diversity of species and varieties in the genus Citrus, is mainly due to the occurrence of mutations and the frequent appearance of polyembryonic seeds. The grapefruit ‘Paraná’ (Citrus sp.) like the majority of the citric species, arose in the Asian Southwest, in contrast with the other grapefruit (C. paradisi) whose center of origin was in the Barbados Islands in the Caribbean. As citrus diploids, ‘Paraná’ grapefruit has chromosome number 2n = 18. In addition to presenting improved industrial characteristics, such as fruit quality and good field behavior, grapefruit ‘Paraná’ has shown high quantitative resistance to canker citrus, a bacterial disease caused by Xanthomonas citri subsp citri. This disease is endemic in the NEA zone, it affects all citrus fruits, but in particular all cultivars of grapefruit are very susceptible. Currently, research in terms of health, mainly are aimed at obtaining new citrus varieties to offset the losses caused by a new disease in the area, whose causative agent is the bacterium Candidatus Liberibacter and causes "greening" or HLB (huanglongbing). Very devastating citrus disease that has caused and continues to greatly affect the production of all citrus varieties. In cultivated plants and especially in Citrus, the characterization of genetic material has been difficult because the high fertility between species, apomictic reproduction and polyembryony are common, as well as the scarcity of polymorphic DNA markers. The identification of varieties and in particular, cultivars derived by spontaneous and induced mutations, remains a difficult task. In this sense, the following hypothesis was proposed: the study of the relative genetic diversity of grapefruit ‘Paraná’ and its corresponding genetic characterization by means of specific molecular markers of the citric genome allows genotyping the material of interest, facilitating the evaluation of the degree of relative kinship of the grapefruit. ‘Paraná’ with the other citrus species. Consequently, the proposed objectives were: to characterize molecularly ‘Paraná’ grapefruit and other citrus species by means of DNA markers. Characterize, using the SSR and RAPD markers, the grapefruit material ‘Paraná’. Estimate possible parental relationships of ‘Paraná’ grapefruit with other known citrus species and varieties. In order to analyze the variability and genetic structure, RAPD and SSR nuclear markers were used. The analysis of the genetic variability by RPAD revealed that the percentage of polymorphic loci and expected average heterozygosis were high in grapefruit ‘Paraná’. However, no exclusive bands were detected. Likewise, the diversity index for the same was also high. The largest number of different alleles was observed in orange ‘Valencia’ (C. sinensis), grapefruit ‘Duncan’ (C. paradisi) and grapefruit ‘Paraná’ (Citrus sp.). However, the percentage of polymorphic loci (PLP) varied between samples, the highest PLP values were generally observed in grapefruit cultivars, among them grapefruit ‘Duncan’ and grapefruit ‘Paraná’ obtained with SSR. The expected heterozygosis and the diversity index were higher in orange ‘Valencia’. However, the variability within each variety was generally poor. The analysis of the genetic structuring of citrus germplasm, indicated that the greatest degree of division is between varieties. In the analysis of molecular variance (AMOVA) the varieties were genetically different from each other and the results were statistically significant. The greatest genetic distance was observed between grapefruit ‘Paraná’ and orange ‘Salustiana’ (C. sinensis) (1,666) and between ‘Paraná’ and ‘Poorman’ (Citrus sp.) (1,020). In turn, the Fst and PhiPT indices indicated a lower genetic distance between grapefruit ‘Paraná’ and orange ‘Valencia’ (Fst 0,233 and PhiPT 0,394) and between grapefruit ‘Paraná’ and C. maxima (pummelo) (Fst 0,311 and PhiPT 0,490). That is to say that these are much more genetically related than any other. The analysis of main coordinates grouped mainly grapefruit ‘Paraná’ and orange ‘Valencia’, and C. maxima very close to them. In the UPGMA analysis, the hybrid grapefruit ‘Poorman’ was differentiated from the rest of the cultivars. In principle, the distinctive morphological characters that allowed agronomically differentiate the cultivars of grapefruit, C. paradisi (‘Marsh’, ‘Foster’, ‘Duncan’, ‘Red Blush’, ‘Red Shambar’ and ‘Star Ruby’), it does not match with the genetic similarity between these. It was possible to differentiate genetically grapefruit ‘Paraná’ and it was considered as a different variant, separated from other grapefruit varieties. It was established that ‘Paraná’ grapefruit is an independent natural hybrid, possibly originated from the crossing of a variant sweet orange (Citrus x sinensis) and pummelo (C. maxima). The comprehensive analysis of grapefruit ‘Parana’, considering the rootstocks (‘Rangpur’, tangelo ‘Orlando’, ‘Citrumelo’ and ‘Duncan’) showed that these do not influence the grouping because there are no differences in terms of distances genetic and the similarities are very high. The results indicated that the visual selection in combination with the SSR analysis for the identification and characterization of hybrids will improve the selection precision, save time and reduce the costs involved in the citrus breeding programs. At the same time, SSR are effective techniques in the identification of genotypes that are often marketed under the same name and that can lead to marketing problems. With this work it was possible to advance in the genetic characterization of grapefruit ‘Paraná’. This favors and at the same time benefits the commercialization, given the demand of the same, since it provides complementary information for the inscription in the INASE. In this way, the study of citrus germplasm and future work for the identification of commercial varieties is strengthened. | - |
| dc.format | application/pdf | - |
| dc.format | 133 p. | - |
| dc.language | spa | - |
| dc.publisher | Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias | - |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | - |
| dc.rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/ | - |
| dc.rights | Atribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Argentina | - |
| dc.source.uri | http://repositorio.unne.edu.ar/handle/123456789/1545 | - |
| dc.subject | Citrus | - |
| dc.subject | Pomelo Paraná | - |
| dc.subject | Frutas cítricas | - |
| dc.subject | Genética | - |
| dc.subject | Marcadores genéticos | - |
| dc.title | Caracterización genética de pomelo 'Paraná' mediante marcadores moleculares | - |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/masterThesis | - |
| dc.type | info:ar-repo/semantics/tesis de maestría | - |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/acceptedVersion | - |
| Aparece en las colecciones: | RIUNNE - Universidad Nacional del Nordeste | |
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